多臂鏈接體（multi-arm linker units）的設計與合成是免疫功坊的核心技術之一。一般來說，每個鏈接體是由一個核心、一到兩個耦合臂、及多個鏈接臂所組成。鏈接體的核心，可以採用一個胜肽鏈核心（peptide core）或是其他種類的化合物。在我們常用的結構裡的胜肽鏈核心，一般帶有多個離胺酸（lysine, K），與一個帶有 azide（疊氮基）或是 alkyne（炔基）官能基的氨基酸或/ 以及一個半胱胺酸（cysteine, C）。支鏈帶有 azide 的氨基酸，一般常用的是 L-azidohomoalanine（AAH），而帶有 alkyne的是 L-homopropargylglycine（GHP）。AAH/ GHP 與半胱胺酸通常是在胜肽鏈核心的兩端，但也可以在中間。在 lysine、AAH/ GHP、與 cysteine 之間是由我們稱為「Z」的間隔所分開，而 Z 通常是用 2-12 個親水性氨基酸，或是用有 2-12 乙二醇單元（ethylene glycol unit）的 PEGylated 氨基酸，其分子式為 NH2-EG2-12-COOH。這些做間隔用的 Z 在同一個核心內，不需要都相同。在胜肽鏈 N 端的 NH2（氨基），是由 acetyl（乙酰基, Ac）所保護。
胜肽鏈核心的例子
在胜肽鏈核心尾端帶有 azide 或是 alkyne 的氨基酸，可作為耦合臂 （coupling arms），與另一個多臂鏈接體經由點擊反應（click reaction）結合。在這樣的組合中，耦合臂是直接當作是胜肽鏈核心的一部份而一起合成。而帶有 cysteine 的胜肽鏈核心，則是提供 SH（巰基）再與耦合臂（maleimide-EG2-12-X）中的 maleimide（馬來酰亞胺）結合，maleimide 也可用 vinyl sulfone 取代。而 X 功能基可從 azide、alkyne、tetrazine（四嗪）、TCO（trans-octene, 反式辛烯）、或 strained alkyne（緊繃性的炔基）像是 DBCO（dibenzyl-cyclo-octyne）、BCN（bicyclo[6,1,0] non-4-yn-9-yl）來做選擇。X 功能基可做為結合兩個多臂鏈接體的耦合基，或是結合一個多臂鏈接體與單一標的或是單一效應元件的耦合基。
在胜肽鏈核心中的 lysine 可提供 NH2 基與一定長度的鏈接臂（linking arms, NHS-EG2-15-Y）中的 NHS（N-hydroxysuccinimide ester）結合。而鏈接臂上的 Y 功能基主要的選擇是 maleimide，但也可選擇 vinyl sulfone、azide、alkyne、tetrazine、TCO、或是 strained alkyne 等。Y 功能基可做為結合標的或是效應元件的耦合基。
多臂鏈接體的建構
在多臂鏈接體中，Y 功能基需與結合多臂鏈接體的耦合基做區別；而當鏈接體都有兩個耦合臂時，其中一個是 azide 或是 alkyne，另一個則是非 azide/ alkyne 的 X 功能基，且與 Y 功能基不同。以下是一些多臂鏈接體的例子：
多臂鏈接體的例子
